Тип 2 Рестрикційні ферменти можуть розрізати ДНК поблизу або в межах послідовності розпізнавання, тому вони найчастіше використовуються в генній інженерії.6 червня 2022 р.
Ферменти рестрикції може плавно розрізати дві взаємодоповнюючі нитки, щоб фрагменти мали тупі кінці. Однак вони зазвичай створюють нависаючі окремі пасма («липкі кінчики») шляхом ступінчастого зрізання.
Приклади
| фермент | джерело | Послідовність виявлення |
|---|---|---|
| SmaI | Serratia marcescens | 5'-CCCGGG-3' 3'-GGGCCC-5' |
| PvuI | Протей звичайний | 5'-CGATCG-3' 3'-GCTAGC-5' |
| SacI | Streptomyces achromogenes | 5'GAGCTC 3'CTCGAG |
| Салі | Streptomyces білий | 5'GTCGAC 3'CAGCTG |
Приклад: EcoRI (рестриктаза з Escherichia coli) розпізнає послідовність GAATTC у подвійному ланцюзі ДНК. Він розрізає подвійне пасмо з 5' нависаннями після Gs. Ці виступи називаються липкими кінцями.
Бактерії захищають себе за допомогою метилаз від ферментативного розрізання власної ДНК. Вони специфічно зв’язуються з тими місцями, де зв’язуються ферменти рестрикції.
гладкі кінці (тупий кінець). У багатьох випадках липкі кінці особливо корисні для лігування фрагментів ДНК, якщо нависаючі основи комплементарні одна одній (комплементарність). Лігування відповідних липких кінчиків становить прибл. У 1000 разів ефективніше, ніж лігування тупих кінців.