Під час екстракції жодного разу 100% етанол не контактує з ДНК. Концентрація етанолу вище 75% під час цього етапу може спричинити подальше спільне осадження забруднюючих речовин, і для його видалення знадобиться більше одного етапу прання.
E100 – чистий етанол. Прямий водяний етанол як автомобільне паливо широко використовується в Бразилії з кінця 1970-х років для чистих транспортних засобів, що працюють на етанолі, а останнім часом і для транспортних засобів з гнучким паливом.
Деякі інші негативні ефекти етанолу на продуктивність автомобіля включають його корозійний характер, що збільшує навантаження на мастильні матеріали та гумові ущільнювачі в регіонах, де вони циркулюють.
Тому що спирти і вода утворюють суміш, яка називається азеотропом, і цей азеотроп не можна розділити за допомогою дистиляції. Щоб наблизитися до 100%, потрібно використовувати осушувач, як-от молекулярне сито (3A) або безводний сульфат кальцію або магнію, щоб видалити більше води.
Етанол вважається кращим розчинником, ніж вода, у фітохімічній екстракції завдяки його здатності витягувати більший вихід біоактивних сполук із лікарських рослин.. Дослідження показали, що екстракція етанолом забезпечує вищий загальний вміст фенолів і антиоксидантну активність порівняно з екстракцією водою.